Leiter

Prof. Dr. rer. nat. Franz Oswald
franz.oswald[at]uni-ulm.de

Universitätsklinik Ulm, Zentrum für Innere Medizin,

Abteilung für Innere Medizin I

Albert-Einstein Allee 23

89081 Ulm

 

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Mitarbeiter

Rosi Rittelmann (Technische Assistentin)
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Sabine Schirmer (Technische Assistentin)
mailto:sabine.schirmer[at]uniklink-ulm.de

Dr. Biol. hum. Peggy Schwarz (Postdoc)

mailto:peggy.schwarz[at]uniklinik-ulm.de

Dipl. Biol. Verena Thiel (Doktorandin)
mailto:verena.thiel[at]uniklinik-ulm.de

Dipl. Biol. Patricia Klöble (Doktorandin)
mailto:patricia.kloeble[at]uniklinik-ulm.de

Leiling Pan (Master Studentin)

leiling.pan[at]uni-ulm.de

Forschungsschwerpunkte

Der Notch Signaltransduktionsweg: Die Entwicklung jedes multizellulären Organismus von der befruchteten Oozyte zu seinem charakteristischen dreidimensionalen Aussehen und seiner Größe ist das Ergebnis komplex koordinierter Genfunktionen. Diese Genfunktionen steuern auf der Ebene einzelner Zellen ein Netzwerk aus Wachstum, Proliferation, Differenzierung, Migration und Apoptose. Die Fähigkeit der Zelle auf externe Signale (z.B. Wachstumsfaktoren und Liganden) durch geeignete Signaltransduktionskaskaden zu reagieren und zu kommunizieren, ist dabei von essentieller Bedeutung. Bei Invertebraten und Vertebraten repräsentiert der Notch Signaltransduktionsweg einen hochkonservierten Mechanismus, der in sehr vielen Entwicklungs- und Differenzierungsprozessen eine entscheidende Rolle spielt. Zusätzlich geht ein dereguliertes Notch Signal oft mit malignen Erkrankungen des Menschen einher.


Die Aufklärung molekularer Mechanismen der Notch-abhängigen Genregulation ist ein Schwerpunkt der Arbeitsgruppe und trägt einerseits zum grundlegenden Verständnis von Transkription bei. Andererseits ergeben sich daraus Möglichkeiten zur molekularen Einflußnahme (z. B. durch „small molecules“) für neue Therapiekonzepte.


Isolierung und funktionelle Charakterisierung beteiligter Proteinfaktoren: Notch Rezeptoren und ihre Liganden sind membranständige Proteine (1) eines Signaltransduktionswegs, der in vielen Entwicklungs- und Differenzierungsprozessen eine entscheidende Rolle spielt. Ligandbindung induziert verschiedene proteolytische Spaltungsprozesse am Notch Rezeptor (S2 und S3) bei denen ADAM Metalloproteasen und ein Gamma-Sekretase Komplex beteiligt sind. Dies führt zur nukleären Translokation der intrazellulären Domäne (NICD) (2). NICD bindet selbst keine DNA, sondern interagiert mit dem sequenzspezifisch DNA-bindenden Protein RBP-Jkappa (RBP-J) (3), um nach Rekrutierung eines Koaktivator Komplexes (4) die Transkription von Notch-Zielgenen zu aktivieren (5). Die Abschaltung der Transkriptionsaktivierung erfolgt über eine schnelle Degradation von NICD im Zellkern nach spezifischen postranslationalen Modifikationen [Phosphorylierung (P), Ubiquitinylierung (Ub)] (6) In Säugern interagieren die intrazellulären Domänen aller vier Notch Rezeptoren mit RBP-J. Somit kommt diesem Protein eine entscheidende Bedeutung im Notch Signaltransduktionsweg zu. RBP-J ist ein hochkonserviertes, ubiquitär exprimiertes Protein und fungiert, solange der Notch Signalweg inaktiv ist, als transkriptioneller Repressor. Seine transkriptionsreprimierende Wirkung entfaltet RBP-J durch die Rekrutierung von Multiprotein-Korepressor-Komplexen (7 und 8). Spezifische Histon-Deacetylasen (HDACs) scheinen dabei wichtige Bestandteile zu sein. Als neue Korepessoren in diesem Komplex konnten von uns SHARP, CtBP und ETO identifiziert werden. SHARP bindet einerseits direkt an RBP-J und rekrutiert andererseits HDACs und weitere HDAC assoziierte Proteine. Der genaue molekulare Mechanismus der RBP-Jkappa vermittelten transkriptionellen Repression ist jedoch noch wenig verstanden. Durch proteinbiochemische, molekularbiologische, zellbiologische und entwicklungs-biologische Verfahren werden in unserer Arbeitsgruppe die molekularen Mechanismen der RBP-J abhängigen Repression, sowie die der NICD vermittelten Transaktivierung näher untersucht (Abb. 1).

Abb.1: Schematische Darstellung des RBP-J/Notch Signalwegs: RBP-J agiert als transkriptioneller Repressor durch die Rekrutierung von Korepressorkomplexen. Nach Aktivierung des Notch Signalweges wird die intrazelluläre Domäne des Notch Rezeptors (NICD) durch proteolytische Spaltungen freigesetzt und in den Zellkern transloziert. Es kommt zur Verdrängung des Korepressorkomplexes und zur Rekrutierung eines Koaktivatorkomplexes. Die Abschaltung der Transkription erfolgt nach einem schnellen Abbauprozess von NICD durch die erneute Bildung von Korepressorkomplexen an RBP-J.

Signalintegration: Die Modulation des Notch Signaltransduktionswegs: Arbeiten der letzten Jahre haben gezeigt, dass während Notch abhängiger Differenzierungsprozesse eine komplexe Modulation der Notch Aktivität stattfindet. Diese Modulation geschieht vor allem auf der Ebene der Notch-Liganden aber auch am Notch-Rezeptor selbst durch spezifische posttranslationale Modifikationen. Wir konnten ein neues, bisher nicht charakterisiertes Phosphoprotein, RITA, identifizieren das über einen unerwarteten nukleo-zytoplasmatischen Transportmechanismus die Verfügbarkeit von RBP-J für aktives Notch im Zellkern und somit die Notch Aktivität negativ reguliert. Im Krallenfrosch (Xenopus laevis) als Modellsystem ist RITA für die neuronale Differenzierung essentiell und wirkt der durch aktives Notch induzierten Hemmung der neuronalen Differenzierung entgegen. Weiterhin induziert RITA die neuronale Differenzierung im Zellkultur Modell. Somit stellt RITA einen evolutionär hochkonservierten Modulator des Notch Signalwegs dar, der zumindest bei neuronalen Differenzierungsprozessen eine kritische Rolle einnimmt. Die Aufklärung der Signaltransduktionskaskade(n), die eine Funktion von RITA als negativer Modulator von Notch beeinflussen, sollen in Zukunft biochemisch, zellbiologisch und mit geeigneten Mausmodellen durchgeführt werden.


Die Rolle des Notch Signaltransduktionswegs bei malignen Erkrankungen und zellulären Alterungsprozessen: Innerhalb von DFG (SFB1074, https://www.uni-ulm.de/einrichtungen/sfb-1074.html) und BMBF (Molecular Systems Biology of impaired Stem Cell Function and Regeneration during Aging “SyStaR”, www.uni-ulm.de/in/systar.html) finanzierten Projekten werden in der Arbeitsgruppe Veränderungen im Notch Signalweg bei Tumoren und zellulären Alterungsprozessen in verschiedenen Tiermodellen und beim Menschen untersucht.


Isolierung und Charakterisierung von neuen fluoreszierenden Proteinen als Werkzeuge für die biomedizinische Forschung: Neben der Aufklärung molekularer Mechanismen der Notch/RBP-J vermittelten Transkriptionsregulation ist ein weiterer Forschungsschwerpunkt der Arbeitsgruppe die Isolierung, Charakterisierung und Optimierung neuer fluoreszierender Proteine aus nichtbiolumineszenten Nesseltieren sowie die Entwicklung geeigneter Biosensoren für die Anwendung in lebenden Organismen und Zellen (Abb. 2).

Abb. 2: Neue fluoreszierende Proteine (FPs) aus nicht biolumineszenten Nesseltieren: Die cDNAs der verschiedenen FPs wurden aus fluoreszierenden Blumentieren gewonnen, in geeignete Vektoren kloniert und bakteriell exprimiert.

Aus den Arbeiten dieses Forschungsschwerpunktes sind u. a. das tiefrot-fluoreszierende Protein eqFP611, dessen monomere Variante mRuby sowie die von grün nach rot fotokonvertierbaren Proteine EosFP und mCavRFP hervorgegangen. In verschiedenen Arbeiten konnten wir die Anwendbarkeit dieser Proteine als molekulare Marker, sowohl für entwicklungsbiologische Fragestellungen als auch in eukaryontischen Zellsystemen aufzeigen und dort maßgebliche Beiträge leisten. Kürzlich konnten wir das von mEosFP abgeleitete mIrisFP für die Anwendung in der optischen Höchstauflösungs-Mikroskopie vorstellen. Die Fluoreszenzfarbe von mIrisFP lässt sich, wie bei mEosFP, durch Bestrahlung mit Laserlicht von grün nach rot umschalten. Darüber hinaus kann sowohl die grüne als auch die rote Form gezielt ein- und ausgeschaltet werden. Durch diese Eigenschaften ist es nun möglich, Proteinwanderungen in der lebenden Zelle in optischer Höchstauflösung zu beobachten (Abb. 3).

Abb. 3: Untersuchung von molekularen Umbauvorgängen an den fokalen Kontakt-punkten einer menschlichen Krebszelle: Oben: Die DNA Sequenz für mIrisFP wurde durch molekularbiologische Methoden mit der kodierenden Sequenz für Paxillin verbunden und in eine menschliche Krebszelle eingebracht. Das daraufhin produzierte mIrisFP-Paxillin Fusionsprotein wird von der Zelle in die so genannten „Fokalen Kontaktpunkte“ transportiert. Durch klassische Fluoreszenzmikroskopie (TIRF) können diese für die Zellwanderung essentiellen Strukturen sichtbar gemacht werden (links). Die Analyse auf molekularer Ebene ist jedoch durch die begrenzte Auflösung nicht möglich (Ausschnitt, rechts oben). Die optische Höchstauflösung (PALM) erlaubt es jetzt Strukturen weit unterhalb der Auflösungsgrenze zu analysieren (Ausschnitt, rechts unten). Unten: Durch die einzigartigen, multi-funktionellen Eigenschaften von mIrisFP, Fotokonvertierbarkeit und Schaltbarkeit in zwei verschiedenen Farbspektren, ist es nun erstmals möglich, in einer lebenden Krebszelle Proteinbewegungen- hier: das Wachstum von spezifischen fokalen Kontaktpunkten- auf der Ebene von einzelnen Molekülen zu analysieren.

Publikationen:

1. Oswald, F., P. Rodriguez, B. D. Giaimo, Z. A. Antonello, L. Mira, G. Mittler, V. N. Thiel, K. J. Collins, N. Tabaja, W. Cizelsky, M. Rothe, S. J. Kuhl, M. Kuhl, F. Ferrante, K. Hein, R. A. Kovall, M. Dominguez, and T. Borggrefe. 2016. A phospho-dependent mechanism involving NCoR and KMT2D controls a permissive chromatin state at Notch target genes. Nucleic Acids Res. (epub ahead of print)

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